Tuna Nehri üzerinde bazı barajların bulunmamasının birkaç nedeni vardır: Ekolojik etkiler: Barajlar, balıkların göç yollarını engelleyerek biyoçeşitlilik kaybına neden olabilir. Ekonomik nedenler: Özellikle bakım ve çevresel koruma maliyetleri, bazı barajların ekonomik olarak sürdürülebilir olmamasına yol açabilir. Siyasi ve hukuki faktörler: Örneğin, Gabčikovo-Nagymaros Barajı projesi, Çekoslovakya ve Macaristan arasında uzun süreli bir hukuki davaya konu olmuş ve bu durum, diğer projelerin gerçekleştirilmesini engellemiştir. Buna karşın, Avrupa genelinde ve özellikle Tuna Nehri havzasında, yaşlanan ve bakıma muhtaç barajların kaldırılması yönünde bir eğilim bulunmaktadır.