The Mortuary Assistant, baş karakter Rebecca Owens'ın, ölümden sonraki bakım hizmetleri sunan bir cenaze evinde işe başlamasıyla başlayan olayları anlatır. Oyun, iki ana temayı işler: 1. Ölüm ve travma: Oyun, ölüm ve travmanın etkilerini, Rebecca'nın deneyimleri ve morgun sahibi Raymond ile etkileşimleri aracılığıyla işler. 2. Şeytani ele geçirilme: Rebecca, hangi cesedin iblis tarafından ele geçirildiğini tespit etmek ve bu iblisleri bertaraf etmek zorundadır. Oyun, ayrıca doğaüstü olaylar, mantıksal düşünme ve detaylara dikkat gerektiren bulmacalar içerir.