Mükellef entegrasyonu, elektronik kayıtların oluşturulması için Gelir İdaresi Başkanlığı (GİB) tarafından sunulan üç seçenekten biridir. Entegrasyon sisteminde: Arşivleme maliyetleri, bilgi işlem ve sunucu yönetimi, teknik kılavuzlardaki ve mevzuattaki güncellemelerin takibi ve uygulanması mükellef tarafından yönetilir. Maliyetler, mükellef tarafından karşılanır. Fonksiyonlar, GİB Portal'a göre daha sınırlıdır. Mükellef entegrasyonu, özel entegratörler aracılığıyla da gerçekleştirilebilir. Entegrasyon ve özel entegratör seçenekleri, işletmelerin e-fatura süreçlerini dijitalleştirmelerine ve zaman ile işgücü tasarrufu sağlamalarına yardımcı olur.