Elektronik imza (e-imza) ile imzalanamayan belgeler arasında, kanunların resmi şekle veya özel bir merasime tabi tuttuğu hukuki işlemler ile teminat sözleşmeleri bulunmaktadır. Bu kapsamda, e-imza ile gerçekleştirilemeyen işlemler: emlak alım satımı; veraset ve intikal; evlenme; noter işlemleri. Ayrıca, yabancı bir ülkeden alınan elektronik sertifikalar, Türkiye'de ancak Türkiye'de kurulu bir Elektronik Sertifika Hizmet Sağlayıcı tarafından kabul edilirse kullanılabilir; aksi takdirde bu sertifikalarla işlem yapılamaz.