Üç domain sistemi, biyolog Carl Woese tarafından 1990 yılında önerilen ve hayatın üç ana kategoriye ayrılmasını içeren bir sınıflandırmadır. Bu kategoriler şunlardır: 1. Archaea: Prokaryotik, tek hücreli organizmalar olup, çekirdek zarından yoksundurlar ve genellikle aşırı ortamlarda yaşarlar. 2. Bakteriler (Bacteria): Prokaryotik organizmalar olup, peptidoglikan hücre duvarına sahiptirler ve çeşitli metabolik kapasitelere sahiptirler. 3. Ökaryotlar (Eukarya): Membranla çevrili çekirdek ve organellere sahip, hayvanlar, bitkiler, mantarlar ve protistleri içeren kompleks hücrelere sahiptirler. Bu sistem, rRNA dizilerinin karşılaştırmalı analizine dayanır ve genetik özelliklere odaklanarak, organizmaların evrimsel ilişkilerini daha doğru bir şekilde yansıtmayı amaçlar.