ANKA-3 ve ANKA-S arasındaki temel farklar şunlardır: Tasarım ve Performans: ANKA-3, uçan kanat formunda olup, düşük radar görünürlüğü ve yüksek hız (0,7 Mach) kapasitesine sahiptir. Görev Amacı: ANKA-3, düşman radarlarına takılmadan uzun mesafelere uçarak keşif, gözetleme ve mühimmatla hedef imha etme görevleri için tasarlanmıştır. Faydalı Yük Kapasitesi: ANKA-3, 1.200 kg faydalı yük taşıyabilirken, ANKA-S'nin faydalı yük ağırlığı 350 kg'dır. ANKA-3, daha gelişmiş ve spesifik bir insansız hava aracı iken, ANKA-S daha genel amaçlı bir platformdur.