Fatih Terim'in başkanla arası, özellikle Galatasaray'da görev yaptığı dönemlerde, genellikle gergin olmuştur. Terim, yönetimle çeşitli konularda anlaşmazlıklar yaşamış ve bu durum, bazı dönemlerde ayrılıklara yol açmıştır. Örneğin, 2013 yılında Galatasaray Başkanı Ünal Aysal ile yaşadığı sorunlar nedeniyle görevinden alınmıştır. Terim, yönetimle olan ilişkilerini genellikle eleştirisel bir dille ifade etmiş ve bu durum, başkanlık iddiaları da dahil olmak üzere çeşitli spekülasyonlara yol açmıştır.