Makedonya turlarında gezilebilecek bazı önemli şehirler şunlardır: 1. Üsküp: Makedonya'nın başkenti, tarihi ve modern unsurların birleştiği bir şehir. 2. Ohrid: UNESCO Dünya Mirası Listesi'nde yer alan, Ohrid Gölü ile ünlü bir şehir. 3. Bitola (Manastır): Osmanlı döneminden kalma tarihi yapılar ve Atatürk'ün eğitim gördüğü Manastır Askeri İdadisi ile bilinir. 4. Struga: Ohrid Gölü'nün kuzeyinde, şiir festivalleriyle ünlü bir şehir. 5. Kruşevo: Makedon Bağımsızlık Hareketi'nin merkezi olarak tanınan, dağ manzaraları ile ünlü bir şehir. 6. Prilep: Tarihi ve doğal güzellikleri bir arada sunan, kaya oluşumları ve eski yapılarıyla dikkat çeken bir şehir.