Sağlıklı bir vajinal florada bulunması gereken başlıca bakteriler laktobasillerdir. En yaygın laktobasil türleri: L. crispatus; L. iners; L. jensenii; L. gasseri. Vajinal florada bulunabilecek diğer bakteri türleri: Atopobium vaginae; Peptostreptococcus spp.; Staphylococcus spp.; Streptococcus spp.; Bacteroides spp.; Fusobacterium spp.; Gardnerella vaginalis; Mobiluncus; Prevotella spp.; Escherichia coli. Ayrıca, mikoplazma ve üreaplazma türleri de sıklıkla vajinal florada bulunur. Vajinal flora, genetik, yaş, cinsiyet, stres, beslenme gibi çeşitli etkenlere bağlı olarak değişebilir.