Sağlıklı bir sünnet yöntemi, kolay ve çabuk uygulanabilen, çabuk yara iyileşmesi sağlayan, kanama, şişme, kızarıklık, morarma gibi sorunları en az olan ve penise zarar vermeyen yöntemdir. Her sünnet yönteminin artı ve eksileri vardır: Dikişli veya yapıştırma yöntemleri, hızlı yara iyileşmesi sağlar. Klipsli (klampli) ve lazerli yöntemler, kanama riskini azaltır. Klipsli ve lazerli yöntemler, ağrı ve acı hissini daha fazla yaşatabilir. Sünnet yöntemi seçimi, kişisel beklentilere ve çocuğun pipi yapısına göre yapılmalıdır. En doğru yöntemi belirlemek için bir uzmana danışılması önerilir.