PET-CT, kanserin her evresinde çekilebilir, ancak genellikle teşhis, evreleme, tedaviye yanıtın değerlendirilmesi ve nüks tespiti gibi aşamalarda kullanılır. Ayrıca, PET-CT'nin onkoloji dışındaki alanlarda da kullanımı vardır, örneğin akciğer kanserleri, lenfoma, meme kanseri gibi spesifik kanser türlerinde.