MR (Manyetik Rezonans) çekimi sırasında vücutta şu olaylar gerçekleşir: Güçlü manyetik alan ve radyo dalgaları kullanılarak vücut içindeki yapıların detaylı görüntüleri oluşturulur. Hidrojen atomlarının çekirdekleri manyetik alan tarafından hizalanır, ardından bu hizalanmış çekirdekler radyo frekansı dalgalarıyla geçici olarak saptırılır. Görüntüleme sırasında hastanın hareketsiz kalması gerekir, çünkü hareket görüntü kalitesini bozabilir. Bazı durumlarda daha net görüntüler elde etmek için damardan kontrast madde enjekte edilir. Yüksek ses çıkabilir, bu nedenle hastaya kulaklık veya kulak tıkacı verilir. MR çekimi genellikle ağrısızdır, ancak kapalı alan korkusu olan kişiler için rahatsız edici olabilir.