MR'da en sık kullanılan kontrast madde, gadolinyum bazlı kontrast maddelerdir. Bu maddeler, damar yoluyla enjekte edilir ve vücuttaki belirli dokuların manyetik özelliklerini geçici olarak değiştirerek, kanlanması artmış veya yapısı bozulmuş dokuların görüntülerde daha parlak görünmesini sağlar. Kontrast madde kullanımı, özellikle tümör, enfeksiyon ve damarsal yapıların değerlendirilmesinde kullanılır. Ancak, böbrek yetmezliği olan hastalarda ve kontrast madde alerjisi olan kişilerde kontrastlı MR çekimi yapılmamalıdır.