Kanamisine dirençli bazı bakteriler şunlardır: Pseudomonas aeruginosa; Streptococcus spp.; Bacteroides spp. ve diğer anaerobik bakteriler; Mantar, virüs ve protozoa. Ayrıca, bazı Gram-pozitif ve Gram-negatif mikroorganizmalar, kanamisine karşı direnç geliştirebilir. Kanamisine karşı direnç gelişimi durumunda, diğer aminoglikozidlere de duyarsızlık söz konusu olabilir (çapraz direnç).