Hipokampus hasar gördüğünde çeşitli rahatsızlıklar meydana gelebilir: Hafıza sorunları: Kısa süreli hafıza kaybı, yeni anılar oluşturmada zorluk, geçmiş yaşantıları hatırlamada güçlük. Yön tayini ve mekansal hafıza problemleri: Yer-yön bulma zorlukları. Duygusal işlemelerde bozukluklar: Duygusal deneyimlerin işlenmesinde sorunlar. Diğer hastalıklar: Alzheimer, epilepsi, depresyon, şizofreni gibi durumlarla ilişkili olabilir. Hasarın etkisi, hangi hipokampusun (sol veya sağ) etkilendiğine bağlı olarak değişebilir. Hipokampus hasarından şüphelenilen durumlarda bir uzmana danışılması önerilir.