Gastroloji ve gastroenteroloji arasındaki temel fark, gastroenterolojinin sindirim sistemi hastalıklarının teşhis, tedavi ve takibini kapsayan daha geniş bir tıp dalı olmasıdır. Gastroloji, mide ve midenin hastalıkları üzerine odaklanan bir bilim dalıdır. Gastroenteroloji ise yemek borusu, mide, ince bağırsak, kolon ve rektum, pankreas, safra kesesi, safra yolları ve karaciğerin normal işlevlerini ve hastalıklarını inceler. Ayrıca, gastroenterohepatoloji terimi de aynı anlamda kullanılmakta olup, mide, bağırsak ve karaciğer hastalıklarıyla ilgilenen bir bilim dalını ifade eder.