Fizyoterapistler, bazı durumlarda belirli tedavileri uygulayamazlar. Bu durumlar şunlardır: 1. Kalp pili olan kişilere ve gebelere cihaz ile fizyoterapi uygulaması yapılmamalıdır. 2. Eklem içi implantı olan kişilere ısıtıcı tedaviler uygulanmamalıdır. 3. İltihaplı romatizmaların aktif süreçlerinde fizik tedavi yapılmasından kaçınılmalıdır. 4. Damar tıkanıklıkları, varisler, açık yaralar, iltihaplı ve kanserli alanlar üzerine uygulama sakıncalı olabilmektedir. Ayrıca, her hastanın durumu farklı olduğu için, fizyoterapi uygulanmadan önce mutlaka bir sağlık uzmanına danışılmalıdır.