Şehzade Mehmed'in ölüm nedeni farklı kaynaklara göre değişiklik göstermektedir: 1. Vikipedi'ye göre, Şehzade Mehmed 22 Aralık 1756'da 42 yaşındayken hastalık sebebiyle ölmüştür. 2. Dtarihi.com sitesinde yer alan bilgiye göre, Şehzade Mehmed, Genç Osman tarafından verilen fetva doğrultusunda boğularak öldürülmüştür. 3. İnternethaberoku.blogspot.com sitesinde ise Şehzade Mehmed'in çiçek hastalığından öldüğü belirtilmektedir.