Eliminasyon yöntemi, genellikle iki aşamadan oluşur: 1. Eliminasyon Aşaması: Süre: Genellikle 2-6 hafta sürer. Yasaklı Gıdalar: Süt ve süt ürünleri, gluten içeren yiyecekler, yumurta, fındık ve kabuklu yemişler, deniz ürünleri, soya ürünleri, şeker ve yapay tatlandırıcılar gibi potansiyel alerjen veya hassasiyet yaratan besinler diyetten çıkarılır. İzin Verilen Gıdalar: Turunçgiller dışındaki meyvelerin çoğu, sebzelerin büyük bir kısmı, karabuğday ve pirinç gibi gluten içermeyen tahıllar tüketilebilir. 2. Yeniden Giriş Aşaması: Süre: Yaklaşık birkaç hafta devam eder. Gıdaların Eklenmesi: Yasaklı gıdalar teker teker ve yavaş yavaş diyete geri eklenir. Tepkilerin İzlenmesi: Belirtiler tekrar ortaya çıkarsa, o gıda sorunlu olarak kabul edilir ve diyetten çıkarılır. Eliminasyon diyeti, bir uzman kontrolünde uygulanmalıdır.