Çocuk hastanelerinde genellikle aşağıdaki bölümler bulunur: 1. Pediatri Bölümü: Genel çocuk hastalıklarıyla ilgilenir. 2. Çocuk Cerrahisi Bölümü: Cerrahi müdahale gerektiren çocuk hastalıklarını yönetir. 3. Yoğun Bakım Ünitesi: Ağır hasta çocukların takibi ve tedavisi için. 4. Çocuk Nörolojisi Bölümü: Nörolojik rahatsızlıkları olan çocukların tedavisi. 5. Çocuk Kardiyolojisi Bölümü: Kalp ve dolaşım sistemi problemleriyle ilgilenir. 6. Çocuk Onkolojisi Bölümü: Kanser hastalıklarıyla mücadele eden çocukların tedavisi. 7. Çocuk Psikiyatrisi Bölümü: Psikolojik sorunlar ve zihinsel rahatsızlıklarla ilgilenir. Bunun yanı sıra, rehabilitasyon, beslenme ve diyet, göz hastalıkları gibi özel alanlara yönelik bölümler de bulunabilir.