Çocuk hastanelerinde bulunan bazı bölümler şunlardır: Çocuk Cerrahisi: Doğumsal anomaliler, yanık ve yaralanmalar, apandisit gibi cerrahi müdahale gerektiren durumlar. Çocuk Hematolojisi: Kan ve kemik iliği hastalıkları. Çocuk Nefrolojisi: İdrar yolları ve böbrek hastalıkları. Çocuk Gastroenterolojisi: Sindirim sistemi hastalıkları. Çocuk Kardiyolojisi: Kalp problemleri. Çocuk Endokrinolojisi: Hormonal bozukluklar. Çocuk Enfeksiyon Hastalıkları: Bulaşıcı hastalıklar. Çocuk Onkolojisi: Tümör ve tümör cerrahisi. Çocuk Ürolojisi: Ürolojik hastalıklar. Çocuk ve Ergen Psikiyatrisi: Zihinsel ve psikolojik rahatsızlıklar. Ayrıca, çocuk hastanelerinde genetik merkezi, yeni doğan yoğun bakım ünitesi ve oyun bölümleri gibi alanlar da bulunabilir.