Koroner BT anjiyografi, doğru koşullarda ve uzman kişiler tarafından yapıldığında genellikle güvenli bir işlemdir. Ancak, bazı riskler içermektedir: Radyasyon maruziyeti. Kontrast maddeye alerjik reaksiyonlar. Böbrek fonksiyonlarında bozulma. Ayrıca, cinsel gücü artırıcı ilaçlar kullanan hastalarda, işlem sırasında verilen dilaltı sprey ile birlikte kan basıncında ciddi düşüşler görülebilir ve bu durum hayati risk oluşturabilir. Koroner BT anjiyografi yaptırmadan önce, olası risklerin değerlendirilmesi için bir doktora danışılması önerilir.