Toyota Supra MK4, 4 ileri otomatik ve 5 ileri manuel şanzıman seçenekleriyle üretilmiştir .
- Manuel şanzıman: 5 ileri W58 .
- Otomatik şanzıman: 4 ileri A340E .
Ayrıca, Avrupa versiyonlarında kaputta bir hava girişi bulunan doğal emişli modellerde, önceki modelden revize edilen 5 ileri manuel W58 şanzıman kullanılmıştır . Turbo modellerde ise yeni bir altı ileri Getrag/Toyota V160 şanzıman eklenmiştir .