Peugeot 407, farklı motor ve donanım seçeneklerine göre çeşitli şanzımanlar kullanmaktadır: Manuel şanzıman: 2004 model Peugeot 407 2.0 HDi (136 bg) 6 ileri manuel şanzıman ile donatılmıştır. Otomatik şanzıman: 2008 model 2.0 HDi dizel otomatik 6 ileri şanzıman (Tiptronic). 2.0 litrelik benzinli ve HDi dizel motorlarla eşleştirilmiş 4 veya 6 ileri otomatik şanzıman (Benzinli otomatik 407'de 4 ileri, dizel otomatik 407'de 6 ileri). Ayrıca, 2005-2008 yılları arasındaki bazı modellerde 4 ileri AL4 şanzıman da kullanılmıştır.