Skoda Octavia RS modellerinde kullanılan şanzımanlar, motor tipine göre değişiklik göstermektedir: Benzinli motor (2.0 TSI) seçenekleri: 6 ileri manuel şanzıman (standart); 7 ileri DSG çift kavramalı şanzıman (opsiyonel). Dizel motor (2.0 TDI) seçenekleri: 6 ileri manuel şanzıman; 6 ileri DSG şanzıman (önden çekişli veya 4x4). Ayrıca, bazı modellerde 7.9 saniyede 0-100 km/s hızlanma sunan 2.0 TDI motor, 6 ileri DSG şanzıman ile 7.9 saniyede bu hıza ulaşmaktadır.