İstanbul Havalimanı'nın tüm fazları tamamlandığında, 500 uçağa kadar hizmet verebileceği belirtilmektedir. Ancak, mevcut durumda havalimanının kapasitesi hakkında kesin bir sayı vermek zordur. Havalimanı, 29 Ekim 2018'de hizmete giren ilk fazda 90 milyon yolcu kapasitesine sahiptir. Ayrıca, "eş zamanlı bağımsız üçlü pist operasyonu" sayesinde, üç uçak aynı anda bağımsız pistlere iniş veya kalkış yapabilmektedir. Bu sistem, havalimanının operasyonel kapasitesini artırmaktadır.