Ford Mondeo'nun sorunlu olarak belirtilen bazı şanzımanları şunlardır: Powershift Şanzıman: Özellikle 1,6 litrelik modellerde ve bazı 2,0 litrelik modellerde vites topuzu üzerinde "Powershift" ibaresi bulunan, çift kavramalı, yağlı ve kuru tip şanzımanlar, sarsıntılı vites geçişleri ve kararsız sürüş dinamikleri nedeniyle şikayet almaktadır. Durashift Şanzıman: Tork konvertörlü, klasik tipte bir şanzımandır. Ancak, 2,0 TDCi motorlu Mondeo'larda kullanılan Aisin marka TF-81, Ford'daki adıyla AF21 şanzımanı ve Jatco JF506E şanzımanlar, genel olarak sağlam ve sorunsuz şanzımanlar olarak belirtilmektedir.