Marmaray ve Avrasya Tüneli aynı projeler değildir. Marmaray, İstanbul Boğazı'nın tabanına yerleştirilen bir tüp geçit olup, raylı sistem için tasarlanmıştır. Avrasya Tüneli ise deniz tabanına yerleştirilmiş, 2 katlı bir karayolu tünelidir ve sadece hafif araçların kullanımına yöneliktir.