"Owari no Seraph" (Seraph of the End) konusu, bilinmeyen bir virüsün tüm insanları öldürmesi ve sadece 13 yaş altındaki çocukları hayatta bırakması etrafında döner. Hikaye, bu çocuklar üzerinde hakimiyet kuran vampirlere karşı intikam yemini eden Yūichirō Hyakuya'nın vampirlerin kökünü kazıma çabalarını anlatır.