Milli Düşünce Merkezi'nin (MDM) amacı, Türk milletinin kalkınmasına, huzuruna, refahına, birlik ve bütünlüğüne hizmet etmektir. Bu amaç doğrultusunda MDM'nin somut hedefleri şunlardır: Türkiye’nin iç ve dış temel sorunlarını belirlemek; Bu sorunlara çözümler aramak; Bugünün ihtiyaçlarına göre bir dünya görüşü ve milli ülkü tespit etmek; Düşünce ve siyaset hayatının temel kavramlarıyla ilgili yayınlar hazırlamak; Milli düşünce yapısına sahip aydınların dağınıklığını giderici çalışmalar yapmak; Tespit edilen kabiliyetli gençleri eğitip yetiştirmek; Yapılan çalışmaları toplumun istifadesine sunmak. MDM, partiler üstü bir yapıya sahiptir ve Türkiye’nin bütünlüğü, egemenliği ve bağımsızlığına saygılı tüm parti ve sivil toplum kuruluşlarına saygı gösterir.