Megaron ve Truva Evi arasındaki temel fark, Megaron'un genel bir yapı tipi, Truva Evi'nin ise bu yapı tipinin belirli bir dönemine ait özel bir örnek olmasıdır.

Megaron, Erken Tunç Çağı'ndan (MÖ 3000'li yıllar) itibaren Ege'de ortaya çıkan, uzun ev modeline uygun, kısa tarafında giriş bölümü olan ve dikdörtgen, büyük bir merkezi ocağı ile sütunlu bir girişi bulunan bir ev tipidir 5.

Truva Evi ise, özellikle Troya'nın belirli katmanlarına ait yapıları ifade eder. Örneğin, Troya 2 (MÖ 2500-2200) döneminde yapılan ve megaron tarzı yapıların görüldüğü evler, Truva Evi olarak adlandırılır 23.

Özetle, Megaron genel bir yapı tipi, Truva Evi ise bu yapı tipinin belirli bir döneme ait özel bir örneğidir.