Baharat Yolu, tarih boyunca farklı dönemlerde çeşitli gruplar tarafından kontrol edilmiştir: İslam'ın yayılışından itibaren (7. yüzyıl), baharat ticareti büyük oranda Müslüman tüccarlar tarafından kontrol edilmiştir. 1453'te İstanbul'un Osmanlılar tarafından fethinden sonra, Osmanlı Devleti, Baharat Yolu'nu sıkı bir vergi sistemi ile denetlemiştir. 16. yüzyıldan itibaren, Mısır, Kızıldeniz, Yemen, Habeşistan ve Basra Körfezi'nde Osmanlı hakimiyeti kurulmuştur. 17. yüzyıldan itibaren, İngiltere ve Hollanda Doğu Hindistan şirketlerinin etkin hale gelmesiyle ticaret, bu şirketlerin kontrolüne geçmiştir. 1869'da Süveyş Kanalı'nın açılmasından sonra, Akdeniz yeniden önem kazanmışsa da baharat ticareti eski önemini korumamıştır.