İnkaların yok olmasının birkaç nedeni vardır: 1. Çevresel Faktörler: İnkalar, yoğun sulama kanalları ve ormansızlaşma gibi çevresel etkiler nedeniyle tarım arazilerini erozyona uğrattılar. Bu, medeniyetin sürdürülebilirliğini olumsuz etkiledi. 2. Hastalıklar: İspanyol işgalcilerin getirdiği salgın hastalıklar, özellikle çiçek hastalığı, İnka nüfusunun büyük bir kısmını yok etti. 3. İç Savaş ve Siyasi Çöküş: İmparator Huayna Capac'ın ölümünden sonra, oğulları Atahualpa ve Huaskar arasında çıkan iç savaş, İnka İmparatorluğu'nun zayıflamasına yol açtı. 4. İspanyol İşgali: Francisco Pizarro ve askerlerinin istilası, İnka İmparatorluğu'nun çöküş sürecini hızlandırdı.