Yunus Emre soruşturmaları iki farklı konuda yürütülmektedir: 1. Polis Memuru Şeyda Yılmaz'ın Şehit Edilmesi: Yunus Emre Geçti'nin polis memuru Şeyda Yılmaz'ı şehit etmesiyle ilgili soruşturma, İstanbul Anadolu Cumhuriyet Başsavcılığı tarafından tamamlanmıştır. 2. Yunus Emre Vakfı'ndaki Yolsuzluk İddiaları: Yunus Emre Vakfı'nda sahte şirketler üzerinden naylon faturalarla zarara uğratıldığı iddialarına ilişkin soruşturma kapsamında, gözaltına alınan 11 kişiden 8'i tutuklanmıştır.