SS kooperatifleri, kendilerine özgü bir yasa olan 1163 sayılı Kooperatifler Kanunu'na tabi olarak özerk bir şekilde faaliyet gösterirler. Bazı durumlarda Türk Ticaret Kanunu (TTK) ve Vergi Usul Kanunu'nun (VUK) bazı hükümleri uygulansa da, kooperatiflerin kuruluşlarından dağılmalarına kadar tüm işlemler Kooperatifler Kanunu'nda belirtilmiştir; bu da kooperatiflere özerklik kazandırmaktadır. SS kooperatiflerinin bağlı olduğu bakanlıklar, kooperatifin türüne göre değişiklik gösterir: Tarımsal amaçlı kooperatifler, tarım kredi kooperatifleri ve bunların üst kuruluşları için Gıda, Tarım ve Hayvancılık Bakanlığı; Yapı kooperatifleri ve bunların üst kuruluşları için Çevre ve Şehircilik Bakanlığı; Tarım satış kooperatifi, kredi ve kefalet kooperatifi, motorlu taşıyıcılar kooperatifi ile diğer tüm kooperatifler ve bunların üst kuruluşları için Gümrük ve Ticaret Bakanlığı ilgili bakanlık olarak gerekli izin işlemini gerçekleştirir.