İstiklal Mahkemeleri'nde yargılananlar arasında asker kaçakları, rejime muhalif kişiler, iktidara destek vermeyen gazeteciler, şapka inkılabına muhalefet edenler, Cumhurbaşkanı Mustafa Kemal'e suikast girişiminde bulunanlar yer almaktadır. Ayrıca, Şeyh Said ve İskilipli Atıf Hoca gibi isimler de İstiklal Mahkemeleri'nde yargılanmıştır. İstiklal Mahkemeleri, 1920-1927 yılları arasında çeşitli dönemlerde kurulmuş ve kapatılmıştır.