Isparta uçak kazasının nedenleri arasında şunlar bulunmaktadır: Pilotaj hatası: Pilotların yön tayinlerinin bozulması ve alçalma planındaki usulleri doğru kullanmamaları. EGPWS (Yer Yaklaşım İkaz Sistemi) arızası: Bu sistem arızalı olduğu için pilotlar yere yaklaşmakta olduklarını anlamamışlar. Hava trafik kontrolündeki aksaklıklar: Kule ile yapılan son konuşmadan sonra uçağın rotasından saptması. Daha önce Isparta'ya uçmamış olmaları: Pilotların MD-83 model uçakla uçmakta tecrübeli olmamaları. Kara delik etkisi: Zemin karanlık olduğu için pilotların yer-gök ayrımını yitirmeleri. Sivil Havacılık Genel Müdürlüğü, kazanın ardından yaptığı açıklamada, uçağın bilinen bir teknik sorununun olmadığını belirtmiştir.