Erkeklerin geç boşalmasının nedenleri fizyolojik, hormonal ve psikolojik olarak üç ana başlıkta toplanabilir. Fizyolojik nedenler: Kan basıncını düşüren kalp hastalıkları, diyabet, prostat sorunları ve idrar yolu enfeksiyonları. Pelvik sinirlerin zarar gördüğü felç, nöropati, omurilik yaralanması veya multiple skleroz gibi nörolojik rahatsızlıklar. Mesane gibi pelvik bölgelerde yaralanma, kısırlık, testosteron seviyesinde düşüklük, peniste sinirsel bozukluklar. Hormonal nedenler: Tiroid hormonu sorunları, hipogonadizm ve Cushing hastalığı gibi hormonal problemler. Psikolojik nedenler: Depresyon ve anksiyete gibi cinsel arzunun azalmasına neden olabilen durumlar. İş stresi ya da çiftler arasındaki ilişkiye dair stres. Alkol ve uyuşturucu madde kullanımı. Toplum baskısı, küçük yaşta tacize uğramış olmak gibi faktörler. Geç boşalma sorunu yaşayan bir erkeğin, sorunun nedenini belirlemek ve tedavi sürecine başlamak için uzman bir doktora danışması önerilir.