E-fatura ve kağıt fatura aynı hukuki niteliklere sahiptir, ancak e-fatura elektronik ortamda hazırlanan bir fatura türüdür. E-fatura ile kağıt fatura arasındaki bazı farklar: Kağıt baskısı: E-faturanın kağıt baskısı geçersizdir. Format: E-faturada zorunlu bir format bulunurken, kağıt faturada serbest format kullanılabilir. Mali mühür ve zaman damgası: E-fatura mali mühür ile oluşturulur, zaman damgası gerektirmez. Alıcıya gönderim: E-fatura doğrudan müşteriye iletilirken, e-arşiv fatura nüsha olarak gerekli portallara iletilir.