Cinsiyet değişikliği için yapılan ameliyatlar, bireyin cinsiyet geçişine göre iki ana kategoriye ayrılır: 1. Kadından Erkeğe Cinsiyet Değiştirme Ameliyatı: Histerektomi: Rahim ve yumurtalıkların çıkarılması. Falloplasti: Penis ve skrotum oluşturulması, genellikle kol derisinden alınan greftlerle. Ses eğitimi ve yüz feminizasyon cerrahisi: Yüz hatlarının erkeksı bir görünüm kazanması için. 2. Erkekten Kadına Cinsiyet Değiştirme Ameliyatı: Vajinoplasti: Penis ve skrotum derisinin kullanılarak vajina oluşturulması. Meme protezi ameliyatı: Meme dokusunun artırılması. Labioplasti: Labiaların şekillendirilmesi. Çene ve elmacık kemiklerinin küçültülmesi: Kadınsı bir yüz görünümü elde etmek için. Cinsiyet değiştirme ameliyatları, plastik cerrahi, üroloji veya jinekoloji gibi alanlarda uzmanlaşan cerrahlar tarafından gerçekleştirilir. Cinsiyet değişikliği için ameliyat olabilmek amacıyla hakim izni ve resmi sağlık kurulu raporu gereklidir.