Yılanların iç organları şunlardır: 1. Dolaşım Sistemi: Üç odacıklı bir kalbe sahiptir. 2. Solunum Sistemi: Genellikle iki akciğerden oluşur, ancak bazı türlerde sol akciğer küçülmüş veya yok olmuştur. 3. Sindirim Sistemi: Avlarını yutarken çene kemikleri ve dişlerini kullanır, sindirim midede başlar ve bağırsaklarda devam eder. 4. Üreme Sistemi: Dişi yılanlar yumurtlar, erkek yılanların ise iki çiftleşme organı (hemipenis) bulunur. 5. Sinir Sistemi: Merkezi sinir sistemi (beyin ve omurilik) ve periferik sinir sisteminden oluşur. Ayrıca, yılanların Jacobson organı adı verilen ve koku alma duyularını kullanan özel bir duyu organı da vardır.