Yılanların bazı iç organları şunlardır: Dolaşım sistemi: Üç odacıklı bir kalbe (iki kulakçık ve bir karıncık) sahiptir. Solunum sistemi: Genellikle iki akciğer bulunur, ancak bazı türlerde sağ akciğer körelmiştir. Sindirim sistemi: Mide, karaciğer ve uzun bir bağırsaktan oluşur. Üreme sistemi: Erkeklerde iki çiftleşme organı (hemipenis) bulunur. Boşaltım sistemi: İdrar kesesi yoktur, üre dışkı ile birlikte kloak yoluyla dışarı atılır. Yılanların iç organları, vücutlarının uzunluğuna ve şekline uygun şekilde evrimleşmiştir.