Hayvan pazarlarında yapılan bazı kontroller şunlardır: Sağlık Raporu ve Pasaport Kontrolü: Hayvanların sağlık raporu ve pasaportları kontrol edilir. Hastalık Kontrolü: Hayvanların hastalık taşıyıp taşımadığı kontrol edilir. Kimlik Kontrolü: Etiket, mühür numarası, sağlık sertifikası ve diğer belgelerle sevkiyat eşleştirilir. Fiziksel Kontrol: Paketleme, sıcaklık, numune alımı ve laboratuvar testleri yapılır. Hijyen ve Dezenfeksiyon Kontrolü: Pazarın temizlik ve dezenfeksiyon durumu kontrol edilir. Yasal Uygunluk Kontrolü: İşletmenin yasal düzenlemelere uygunluğu, örneğin TÜRVET ve TÜRKVET sistemlerine kayıt, atık yönetimi, su analizi gibi unsurlar kontrol edilir. Ayrıca, hayvan satış yerleri, 5996 sayılı Kanun hükümlerine uyulup uyulmaması yönünden Bakanlık merkez ve il/ilçe müdürlüklerince görevlendirilen veteriner hekimler tarafından periyodik olarak denetlenir.