Mu kıtasının yok oluşuyla ilgili öne sürülen bazı teoriler şunlardır: Deprem ve tsunami: James Churchward'a göre, Mu kıtası 12.000 yıl önce bir deprem, tsunami veya tufan sonucunda yok olmuştur. Meteor çarpması: Bir teoriye göre, çok büyük bir meteorun Mu kıtasına çarpması felakete yol açmıştır. Gaz kütleleri: Churchward, kıtaların altında bulunan büyük gaz kütlelerinin zayıf noktalardan yeryüzüne çıkarak ceplerin boşalmasına ve kıtaların batmasına neden olduğunu öne sürmüştür. Savaş ve teknolojik felaketler: Bazı mitos ve efsanelerde, Mu ve diğer uygarlıklar arasında üstün silahların kullanıldığı bir savaş sonucu büyük depremler ve dev dalgaların oluştuğu ve bu şekilde kıtaların yok olduğu iddia edilir. Bu teoriler bilimsel olarak kanıtlanmamıştır ve Mu kıtasının var olmuş olması fiziksel olarak mümkün görülmemektedir.