OEKO-TEX ve GOTS arasındaki temel farklar şunlardır: Amaç: OEKO-TEX, tekstil ürünlerinin güvenliği ve insan sağlığına uygunluğunu belirlemeyi amaçlar. GOTS, organik tarım ve çevre dostu üretimi teşvik eder. Kapsam: OEKO-TEX, tekstil ürünlerinin kimyasal madde içeriği ve işçi sağlığına odaklanırken, GOTS organik tarım ve sürdürülebilir üretim süreçlerine odaklanır. Kimyasallar: OEKO-TEX, zararlı kimyasal madde kullanımını sınırlarken, GOTS kimyasal gübreler ve pestisitlerin kullanımını tamamen yasaklar. Üretim Süreci: GOTS, ürünün tüm üretim sürecini değerlendirir ve sürdürülebilir üretimi teşvik ederken, OEKO-TEX ürünün son haliyle ilgilenir. Her iki sertifikasyon da pamuk, keten, yün ve diğer doğal liflerden üretilen tekstil ürünlerini kapsar.