"Scooby Doo: Cadının Hayaleti" filmi, Scooby-Doo ve Gizem Çetesi'nin ünlü bir korku romanı yazarının ve onun cadı olduğu söylenen atasının karıştığı tuhaf olayları araştırmak için Oakhaven, Massachusetts'i ziyaret etmelerini konu alır. Ekip, bu sessiz kasabada bile yazarın atası olan ünlü bir şifacının hayaletinin dolaştığını öğrenir ve tatili bırakıp bu gizemin peşine düşer.