Ninja Kaplumbağalar arasında en iyisinin kim olduğu konusunda kesin bir görüş yoktur, çünkü her bir karakterin kendine özgü yetenekleri ve özellikleri vardır. Bazı karakterlerin öne çıkan özellikleri: Leonardo: Grubun lideridir ve dövüş sanatları konusunda uzmandır. Raphael: En sinirlisi olup, düşünmeden girdiği aksiyonlarda en iyi hareketlerini sergiler. Michelangelo: Çizgi romanlara ve korku filmlerine ilgi duyar, sakarlığı ve yaramazlığıyla dikkat çeker. Donatello: Teknolojik deneylerle uğraşır ve kaplumbağalar için gelişmiş donanımlar yapmaya çalışır. En güçlü Ninja Kaplumbağa konusunda da farklı görüşler bulunmaktadır; örneğin, bazı kaynaklara göre en güçlüsü Raphael iken, diğer bir görüşe göre ise Donatello'dur.