Junji İto'nun en iyi kitabı konusunda kesin bir görüş birliği yoktur, ancak bazı kaynaklar tarafından önerilen en iyi kitapları şunlardır: 1. "Uzumaki": Üç ciltlik bu seri, İto'nun magnum opusu olarak kabul edilir ve genellikle en iyi eseri olarak gösterilir. 2. "Sensor": H.P. Lovecraft'ın eserlerine benzeyen bu kitap, İto'nun karakter-odaklı ve deneysel bir çalışmasıdır. 3. "Tomie": İto'nun ilk yayınlanan mangası olup, geleneksel ve bilinen bir korku hikayesidir. 4. "The Liminal Zone": Bu koleksiyon, Japonya'nın ünlü mitlerine dayanan dört hikayeden oluşur ve 2022'de yayımlanan en iyi çizgi romanlardan biri olarak değerlendirilmiştir.