Generator Rex'in 2. sezonunda yaşanan bazı önemli olaylar şunlardır: 1. Rampage: Van Kleiss, Noah'ı bir Evoya dönüştürür ve Noah şehirde bir rampage başlatır. 2. Wasteland: Rex ve Six, nükleer malzeme almak için bir araştırma denizaltısına gider ve bir sualtı Evos kolonisiyle karşılaşırlar. 3. Lost Weekend: Rex ve Jones, tehdit oluşturup oluşturmadıklarını belirlemek için bir partiye sızarlar. 4. Alliance: Rex ve Bobo, Kiev'e giderek kubbeyi tamir etmeye çalışırlar ve Van Kleiss'in Noface ile ittifak kurduğunu öğrenirler. 5. Robo Bobo: Bobo'nun davranışları değişir ve Rex, arkadaşının ne olduğunu öğrenmeye çalışır. 6. Six Minus Six: Six, Rex'in anılarını geri kazanmaya çalışırken kendi anılarını kaybeder ve eski kişiliğine döner. 7. Night Falls: Rex ve Caesar, Meksika'daki Abuelalarını ziyaret ederler ve Hunter Cain geri döner.