Mantar temizliğinde sirkeli su kullanımı, bazı uzmanlar tarafından tavsiye edilmemektedir. Sirkenin asidik yapısı, mantar gibi hassas sebzelerde dokuyu bozabilir ve doğal tadı değiştirebilir. Ancak, bazı kaynaklarda sirkeli suyun, mikroorganizmaları öldürmede etkili olduğu belirtilmektedir. En doğru yöntem olarak, mantarların kısa süreliğine tuzlu suda bekletilip ardından temiz bir bezle ya da fırça ile silinmesi önerilmektedir. Mantar tüketimi veya temizliği konusunda kesin bir karar almadan önce bir uzmana danışılması tavsiye edilir.