Havale ve EFT arasındaki temel farklar şunlardır: Kullanılan bankalar: Havale, aynı banka içindeki farklı hesaplar arasında gerçekleşirken; EFT, farklı bankalar arasında gerçekleşir. İşlem süresi: Havale genellikle aynı gün içinde tamamlanırken, EFT işleminin tamamlanması birkaç saat ile birkaç iş günü sürebilir. Ücretler: Havale hızlı olması nedeniyle daha yüksek ücretler talep edebilirken, EFT genellikle daha düşük ücretlidir. Ayrıca, EFT işlemleri belirli saat aralıklarında gerçekleştirildiğinden, bankanın belirlediği saat dilimlerine dikkat edilmesi gerekir. Son yıllarda, FAST (Hızlı Fon Transferi) sistemi ile EFT işlemlerinde saat sınırı kaldırılmış ve 7/24 para transferi yapmak mümkün hale gelmiştir.