Gümrük Birliği'nde Türkiye'nin dezavantajları şunlardır: 1. Dış Ticaret Açığının Büyümesi: Türkiye'nin AB ile olan ticaretinde ithalatın hızla artması, dış ticaret açığının büyümesine neden olmuştur. 2. Üçüncü Ülkelerle Ticaretin Olumsuz Etkilenmesi: Türkiye, AB'nin imzaladığı Serbest Ticaret Anlaşmalarına (STA) doğrudan taraf olamadığı için, üçüncü ülkelerle olan ticaretinde rekabet dezavantajı yaşamaktadır. 3. Sanayi Sektöründe Rekabet Gücünün Zayıflaması: AB ülkelerinden gelen ucuz ithalat, yerli üreticilerin rekabet gücünü azaltmış ve yerli üretimin daralmasına yol açmıştır. 4. Tarım Sektöründe Zararlar: AB'den gelen tarımsal ürünlerin daha ucuz olması, Türk çiftçilerinin pazar kaybına ve fiyat düşüşlerine neden olmuştur. 5. Hukuki ve Düzenleyici Uyum Zorlukları: Gümrük Birliği sürecinde Türkiye'nin AB standartlarına uyum sağlamak için yaptığı düzenlemeler, küçük ve orta ölçekli işletmeler için yüksek maliyetler ve bürokratik engeller yaratmıştır.